Пакет программ для проверки устойчивости туберкулезных штаммов к препаратам создали иркутские ученые

Иркутские ученые создали онлайн-сервис для автоматизированной проверки устойчивости штаммов M. tuberculosis к противотуберкулезным препаратам (ПТП).

Команда Института эпидемиологии и микробиологии ФГБНУ «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека» разработала пакет программ, который в 2022 году был успешно апробирован на пиразинамиде, сообщает пресс-служба института. В 2023 году ученые расширили возможности программы, добавив функционал для прогнозирования устойчивости штаммов к бедаквилину, рифампицину и изониазиду. Работа выполнена по гранту Российского научного фонда. Результаты исследования генетического определения устойчивости к бедаквилину опубликованы в журнале «Acta biomedica scientifica» №6 (2023).

– Выявление специфических генных мутаций, связанных с устойчивостью к ПТП, позволили расширить возможности науки и медицины. Теперь персонализированный подход к лечению туберкулеза становится более значимым, позволяя определить продолжительность воздействия препаратов у каждого пациента. Одним из наиболее многообещающих подходов генетического определения устойчивости к противотуберкулезным препаратам является полногеномное секвенирование (определение нуклеотидной последовательности ДНК) возбудителя туберкулеза и последующая автоматизированная интерпретация данных с помощью специальных программ. – объяснил доктор медицинских наук, главный научный сотрудник, заведующий отделом эпидемиологии и микробиологии НЦ ПЗСРЧ и руководитель проекта по гранту РНФ Олег Огарков.

В 2023 году коллектив ученых представил дальнейший этап работы по проекту – расширенную версию онлайн-сервиса, позволяющего теперь определять устойчивость еще к таким лекарственным противотуберкулезным препаратам, как бедаквилин, рифампицин и изониазид.

В течение году ученые выявляли устойчивость к бедаквилину методом молекулярно-биологического анализа генетических последовательностей генов-мишеней, включая секвенирование по Сэнгеру и полногеномное секвенирование, с последующим определением резистентности к препарату с помощью автоматизированной системы BSATool.

Работа над улучшением сервиса BSATool будет продолжена. Разработчики намерены расширить ее функционал для охвата анализа мутаций, вызывающих устойчивость также к препаратам линезолид и деламанид. Также в планах ускорить внедрение этого важного инструмента в клиническую практику. В частности, он может быть рекомендован для лабораторий, осуществляющих секвенирование по методу Сэнгера.